生殖器疱疹HSV感染后平均约4～5日，外阴患部先有灼热感，旋即发生成群丘疹，可为一簇或多簇，继之形成水疱。数日后演变为脓疱，破溃后形成糜烂或浅溃疡，自觉疼痛，较后结痂自愈，病程约2～3周。

比较好次疱疹病毒感染后1年内有将近60%的患者复发。比较好年可复发4~6次，以后次数减少。发热、月经来潮、性交、情绪激动、消化不良或气候变化均可成为复发的诱因。复发一般都在原处，但水疱数目、持续时间和自觉症状均比原发者轻，淋巴结不肿大。生殖器感染II型疱疹病毒者，复发更多。有资料介绍，I型疱疹病毒感染只有14%复发，而II型疱疹病毒感染复发率则60%。原发或复发生生殖器疱疹可伴有排尿困难、急性尿潴留、脑炎、子宫内膜炎。

由于病情反复发作，又无特效药物控制，加之难以忍受连药物亦无法制止的烧灼样局部疼痛，常常使患者产生沉重的心理负担。他们害怕疼痛、害怕传染给与其有性关系的人、害怕癌变。肉体的痛苦加上精神的负担，往往使患者自尊心受挫，使之不愿与异性交往，从而导致性功能障碍，影响夫妻感情及家庭的和睦，久而久之甚至发生抑郁症。